可可發酵菌種篩選、純化與鑑定

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Title:	可可發酵菌種篩選、純化與鑑定
Authors:	胡淳怡
Contributors:	健康暨護理學院
Date:	2019-12
Issue Date:	2020-04-09T06:48:52Z (UTC)
Abstract:	我們從發酵161小時的可可豆樣本中，針對16S megagenomics區間進行序列定序，共定序出總長度分別為13.1 Mb(CC1)及53.8 Mb(CC2)。結果發現：在CC2樣品序列比對結果發現，數量前三大之OUT菌群與CC1樣品序列分析結果相同，樣品之菌相第一為Acetobacteraceae (醋桿菌)為最大宗，第二為Enterobacteriaceae (腸內細菌)，第三為Paenibacillaceae (類芽孢桿菌)，而三個菌科OUT總合佔所有OUT之97％。屬於發酵前期之乳酸菌至發酵終點時，族群數量變少，故不易篩選。以MRS培養基在厭氧環境下，篩選出的未知菌株，透過EMB鑑別培養基培養後，出現綠色金屬光澤，以此判定為 E. coli ，乳酸菌No1~3皆為E. coli。後期多以醋酸菌為主發酵，No1, 10, 11皆為醋酸菌，經序列比對為Acetobacter pasteurianus (100% identities)；而No 9為G(+)菌Bacillus thuringiensis (100% identities)。真菌選殖過程中未出現酵母菌，但出現單一綠黴菌，此菌為果腐黴菌，可能可可樹於種植過程中曾遭受真菌感染。
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